從祭祀器物中，看見世代延續的信仰。

黑令旗

「黑令旗」扮演著極其重要且神聖的角色。許多人常因影視作品或靈異節目，將黑令旗誤解為不祥之物，但實際上，它在道教與廟宇文化中是代表神明權威、調度兵馬、鎮驅煞氣的至高法器。

拜殿龍柱

因創廟年代久遠，歷史文物之多允居府城寺廟前列。三川門與拜殿各一對清朝中期前的石雕龍柱，單龍盤柱古樸無華，三川門之龍柱落款嘉慶戊寅年（1818年），為目前府城可見各廟龍柱年代最早者。而內廷拜殿龍柱風化情況更甚，且尚無殿外龍柱之鏤空雕造型，評估應為廟史紀錄中乾隆十一年石文耀發起修繕所留下。

普濟殿的青花瓷香爐為直筒型青花圈足爐，上方註明年代是1890年。

面向爐身是長方形開光神座，神座開光內是楷體銘文，中行直書「臺郡普濟殿王府座前」右款「直書光緒庚寅十六年荷月吉立」，左款是「深滬船戶金懋成弟子吳世猴敬獻」。

此香爐具備完整年代及捐贈者資訊，桶內仍存滿香灰，是普濟殿現存文物中年代明確且外型辨識度高者之一，現典藏於普濟殿文物館。

位於池王爺的拜亭，與門檻相連由同樣一塊大石雕刻成的一對石獅，龍邊公獅戲球，虎邊母獅扶子，石材堅硬雕工細緻，和三川門龍柱同為嘉慶戊寅年（1818年）。傳聞曾有鄉民夜間於附近魚塭見獸類追逐並有鈴鐺作響，廟口石獅卻不知去向，感念這對石獅會奔馳巡查境內，特別享有人們的香火祭祀。

這對石獅受孩童喜愛，也對孩童特別關照。早期物資不豐，石獅是當地孩童攀爬玩耍的對象，現普濟殿總幹事自述也曾是爬騎石獅的一員。

2022年由百廟門計劃的TSJ團隊修復後，現典藏於普濟殿文物館的六扇門神，是1978年由府城彩繪大師潘麗水繪製，原為池王爺殿的三川門使用。符合典型王爺廟的男性門神傳統，中門是武將秦叔寶、尉遲恭，另外四扇為三多、多福、簪花、晉爵等文官。

線條銳利、裝飾華麗和筆法精細如鬍鬚的蓬鬆半透明、眼神靈活均是麗水師的特色。2003年普濟殿重修由潘岳雄老師繪製新的廟門，現於普濟殿可同時觀賞潘家兩代大師門神作品。